Почему NGS-закупка начинается до library prep

NGS workflow не начинается с одного kit. Перед library prep лаборатория обычно проходит sample collection, extraction, QC, fragmentation или enrichment, затем использует индексы, панели, adapters и reagents под конкретную платформу и задачу. Поэтому закупочный список должен отражать весь workflow, а не только один QIAseq-набор.

Если артикулы известны, можно оформить быстрый заказ. Если workflow подбирается впервые, лучше идти от образца, целевого анализа и платформы секвенирования.

Что написать в NGS-заявке

NGS-заявка должна показывать весь путь до библиотеки, а не только название QIAseq. Это помогает не забыть indexes, adapters, cleanup и sample prep.

Удобный формат комментария:

  • sample input: DNA, RNA, cfDNA, FFPE, microbiome или другой материал;
  • цель: library prep, targeted panel, indexes, adapters, cleanup или полный workflow;
  • количество: samples, libraries, reactions или наборов;
  • совместимость: платформа, прибор или утвержденная методика, если это важно;
  • замена: допустима или только после согласования с лабораторией.

Что уточнить до выбора QIAseq

  • Тип входного материала: DNA, RNA, cfDNA, FFPE, microbial или другой образец.
  • Какой sample prep уже используется.
  • Нужен ли targeted panel, library prep, index kit, FastSelect или related reagent.
  • Какая платформа и формат sequencing workflow планируются.
  • Требуются ли UMI, enrichment, depletion или специальный panel design.
  • Есть ли прошлые Cat. no. из validated workflow.

Эти вопросы не заменяют техническую документацию, но помогают правильно выбрать раздел каталога и не забыть сопутствующие позиции.

Sample prep перед NGS

Перед NGS часто нужно отдельно закупать наборы для выделения ДНК/РНК, cfDNA, FFPE workflows или microbiome samples. Если качество входного материала критично, лучше не смешивать sample prep и library prep в один общий пункт заявки.

Практические проверки:

  • тип образца и целевая молекула;
  • требования downstream-секвенирования;
  • совместимость extraction kit с дальнейшим workflow;
  • отдельные расходники и controls;
  • Cat. no. для каждой позиции.

QIAseq и library prep

QIAseq-направление может включать library prep kits, targeted panels, RNA/DNA sequencing reagents, indexes и дополнительные позиции. В закупке важно отделить основной kit от индексов, adapters и вспомогательных реагентов, чтобы счет совпадал с реальным workflow лаборатории.

Практические проверки:

  • тип библиотеки и целевая панель;
  • количество образцов и индексирование;
  • совместимость с платформой;
  • дополнительные reagents, cleanup или depletion steps;
  • точные Cat. no. и фасовки.

Внутренние ссылки

Как собрать заявку

Разбейте заказ на блоки: sample prep, library prep, panels/indexes, cleanup, controls и расходники. Для каждого блока укажите Cat. no., количество, задачу и допустимость замены. Если часть workflow уже утверждена лабораторией, приложите прошлый счет или список артикулов.

Технические параметры, protocols, sample input, ограничения применения, условия хранения и совместимость нужно сверять по официальной документации производителя.

FAQ

Можно ли заказать только QIAseq kit?

Иногда да, если все остальные компоненты уже есть. Но часто нужны индексы, панели, sample prep, cleanup или другие связанные позиции.

Что важнее для NGS-заявки: платформа или образец?

Нужны оба параметра. Образец определяет sample prep, а платформа и метод анализа влияют на library prep, indexes и panels.

Нужно ли включать extraction kit в NGS-заявку?

Если лаборатория закупает весь workflow, да. Если extraction уже закрыт другой поставкой, достаточно указать это в комментарии.

Можно ли заменить QIAseq-набор похожим?

Только после проверки workflow, целевой панели, совместимости, input requirements и официальной документации производителя.

Где быстрее заказать известные артикулы?

Через быстрый заказ по Cat. no. Если артикулы неизвестны, начните с NGS-подборки и QIAseq library prep.

CTA

Для подбора откройте NGS-направление QIAGEN и QIAseq Library Prep. Для готового списка используйте быстрый заказ.

Следующий шаг

Перейти от материала к закупке

Найдите нужную товарную группу в каталоге или добавьте известные Cat. no. через быстрый заказ.

Быстрый заказ Открыть каталог