Почему FFPE нужно описывать как workflow
FFPE-запрос редко сводится к одному названию набора. Лаборатории может понадобиться выделение ДНК, выделение РНК, cleanup, bisulfite workflow, PCR/qPCR или NGS library prep. Поэтому в заявке нужно описать весь путь от образца до downstream-анализа.
Если Cat. no. уже утвержден в методике, лучше повторять его. Если закупка новая, сначала нужно разделить позиции по этапам и проверить совместимость каждого SKU.
Что уточнить по образцу
Для FFPE важны тип материала, состояние образца и дальнейший метод. Эти данные помогают не перепутать близкие sample prep решения.
Проверьте:
- нужен DNA, RNA или combined workflow;
- исходный формат FFPE-материала;
- downstream-анализ: PCR, qPCR, NGS, methylation или другой метод;
- нужен ли cleanup или conversion step;
- количество подготовок и фасовку;
- прошлый Cat. no. и допустимость замены.
Связь с qPCR, NGS и methylation
После FFPE sample prep часто идут qPCR, targeted sequencing, library prep или methylation workflow. В заявке полезно указать downstream-задачу: это помогает проверить, нужны ли QIAseq, EpiTect, QIAquick или другие связанные позиции.
Если workflow включает несколько этапов, оформите их отдельными строками: sample prep, cleanup, conversion, library prep и PCR/qPCR reagents.
Документы и ограничения
Протоколы, условия хранения, ограничения применения, RUO/IVD-статус и совместимость нужно сверять по документации производителя для конкретного SKU. Внутренний материал помогает собрать закупочный список, но не заменяет методику лаборатории.
Внутренние ссылки
- Наборы QIAGEN для выделения ДНК и РНК
- QIAamp наборы QIAGEN
- RNeasy наборы QIAGEN
- QIAquick purification
- EpiTect QIAGEN
- QIAseq Library Prep
- therascreen QIAGEN
FAQ
Можно ли заказать FFPE-набор только по типу образца?
Лучше указать Cat. no., целевую молекулу и downstream-анализ. Само слово FFPE не описывает весь workflow.
FFPE DNA и FFPE RNA закупаются одинаково?
Нет. Нужно уточнять целевую молекулу, методику и совместимые downstream-позиции.
Когда нужен cleanup?
Если cleanup указан в методике или нужен перед следующим этапом. Он закупается отдельным SKU.
Что писать в комментарии к заявке?
Тип материала, DNA/RNA target, downstream-анализ, прошлый Cat. no. и необходимость связанных позиций.
Где проверять протоколы?
По документации производителя для конкретного SKU и методике лаборатории.
CTA
Начните с раздела выделения ДНК и РНК. Если список артикулов готов, используйте быстрый заказ.
Следующий шаг
Перейти от материала к закупке
Найдите нужную товарную группу в каталоге или добавьте известные Cat. no. через быстрый заказ.